Η εκπόνηση της διδακτορικής μου διατριβής πραγματοποιήθηκε στο Εργαστήριο Ιστολογίας-Εμβρυολογίας της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών κατά το χρονικό διάστημα 2003-2006 υπό την επίβλεψη του Καθηγητή Β. Γοργούλη. Τόσο κατά τη διάρκεια της όσο και κατά τη μεταδιδακτορική έρευνά μου, ως μέλος της Ομάδας Μοριακής Καρκινογένεσης, απόκτησα μεγάλη εμπειρία με ποικιλία μοριακών τεχνικών, κατορθώνοντας να συνδυάσω την κλινική Πνευμονολογία με τη βασική έρευνα. Το ερευνητικό μου πεδίο επικεντρώνεται κυρίως σε ανίχνευση προνεοπλασματικών βλαβών στον καρκίνο του πνεύμονα καθώς και σε μελέτη των φαινομένων του κυτταρικού κύκλου που οδηγούν σε χρωμοσωμική αστάθεια στα διάφορα νεοπλάσματα.
Ειδικότερα, ερεύνησα εκτενώς τις κεντροσωμιακές ανωμαλίες και τη συσχέτισή τους με την έκφραση της κυκλίνης Ε και την ανευπλοειδία στο μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα. Η μεταδιδακτορική μου έρευνα αφορά τη μελέτη του skp2 ως πιθανού γονιδιακού θεραπευτικού στόχου στα διάφορα νεοπλάσματα μέσα από τη βιοαναδραστική σχέση του με τις κυκλινο- εξαρτώμενες κινάσες p27 και p57. Παράλληλα μελέτησα την παθολογική έκφραση των γονιδίων αδειοδότησης αντιγραφής του DNA, hCdt1 και hCdc6 σε προκαρκινικά στάδια.

ΕΠΙΛΕΓΜΕΝΕΣ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ

• MARILENA KOUTSAMI, Georgia Velimezi, Athanassios Kotsinas, Konstantinos Evangelou, Athanassios G Papavassiliou, Christos Kittas, and Vassilis G. Gorgoulis. Is exclusive Skp2 targeting always beneficial in cancer therapy? Blood, 1 December 2008, Vol. 112, No. 12, pp. 4777-4779. IF2010: 10.558, Cited in: 2 Journals
• Liontos M*, KOUTSAMI M*, Sideridou M*, Evangelou K, Kletsas D, Levy B, Kotsinas A, Nahum O, Zoumpourlis V, Kouloukoussa M, Lygerou Z, Taraviras S, Kittas C, Bartkova J, Papavassiliou AG, Bartek J, Halazonetis TD, Gorgoulis VG.Deregulated overexpression of hCdt1 and hCdc6 promotes malignant behavior. Cancer Res. 2007 Nov 15;67(22):10899-909. IF2010: 7.856, Cited in: 58 Journals and 4 Scientific Books (American Association for Cancer Research, William H. Donner Foundation, Androgen Action in Prostate Cancer- Molecular Themes in DNA Replication - Σελίδα 409- Key Topics in Surgical Research and Methodology)
• Pateras SI, Apostolopoulou K, KOYTSAMI M, Evangelou L, Tsantoulis P, Liloglou T, Nikolaidis G, Sigala F, Kittas C, Kotsinas A, Gorgoulis V: Inhibition of the SKP2-degradation pathway along with CDKN1C promoter demethylation restores p57KIP2 levels in non-small cell lung cancer. Int J Cancer. 2006 Dec 1; 119(11):2546-56. IF2011: 5.444, Cited in: 49 Journals
• KOUTSAMI ΜΚ, Tsantoulis PK, Kouloukoussa M, Apostolopoulou K, Pateras IS, Spartinou Z, Drougou A, Evangelou K, Kittas C, Bartkova J, Bartek J, G Gorgoulis V: Centrosomal abnormalities are frequently observed in non-small-cell lung cancer and are associated with aneuploidy and Cyclin E overexpression. J Pathol 2006, Volume 209, 4: 512-521, IF2010: 6,318, Cited in: 32 Journals and 2 scientific books (The Centrosome, Heide Schatten, HumanaPress, Mortalin Biology: Life, Stress and Death, Sunil Kaul, Renu Wadhwa, Springer)
• KOUTSAMI MK, Doussis-Anagnostopoulou I, Papavassiliou AG, Gorgoulis VG. Genetic and molecular coordinates of neuroendocrine lung tumors, with emphasis on small-cell lung carcinomas. Mol Med 2002 Aug;8(8):419-36. IF2011: 4.668. Cited in: 12 Journals and 1 Scientific Book (Carcinomas: Webster's Facts and Phrases)
• KOUTSAMI MK, Gorgoulis VG, Kastrinakis NG, Asimacopoulos PJ, Kittas C: Prognostic factors in non-small cell lung carcinoma. Anticancer Res 2002 Jan-Feb; 22 (1A):347-74. IF2010: 1,656. Cited in: 7 Journals and 1 Scientific Book (Carcinomas: Webster's Facts and Phrases)

ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΚΕΣ ΑΝΑΦΟΡΕΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΩΝ ΠΡΩΤΟΚΟΛΛΩΝ ΣΕ ΤΕΧΝΙΚΑ ΕΓΧΕΙΡΙΔΙΑ

• Mouse Anti-Actin, beta Monoclonal Antibody, Unconjugated, Clone AC-15 from Abcam
• Cyclin E antibody [13A3] (ab9517) datasheet from Abcam 
• cyclin E (C-19): sc-198 from Santa- Cruz Biotechnologies

Γνώση Μοριακών Τεχνικών

In Situ

• • Ανοσοϊστοχημεία
  • Ανοσοφθορισμός
  • Ανάλυση πλοειδίας με χρώση Feulgen
  • Μέθοδος ΤUNEL (In situ απόπτωσης)
  • Μέθοδος Sa-beta-Gal (κυτταρική γήρανση)

In Vitro

• • Στύπωμα κατά Western
  • Απομόνωση DNA, RNA
  • Αλυσιδωτή Αντίδραση Πολυμεράσης (PCR)
  • Κυτταροκαλλιέργειες
    • Καμπύλες ανάπτυξης κυτταρικού πληθυσμού
    • Επαγώγιμα κυτταρικά συστήματα
    • Διαμόλυνση με μικρο-παρεμβαλλόμενο RNA (μονό/διπλό siRNA- Αποσιώπηση γονιδίων)
    • Εφαρμογή in situ και in vitro τεχνικών σε κυτταρικούς πληθυσμούς

In Vivo

• • Τομές σε πειραματόζωα.